在中共十六届六中全会举行期间，新华社下属的《瞭望》杂志刊登文章抨击中央政府机构中部门利益现象日益突出，指有些中央部门过于强调、维护与谋取本部门利益，损害了社会公正与大众利益，增添了国家经济及政治风险。
这篇由中国现代国际关系研究院经济安全研究中心主任江涌撰写的文章指出，中央机构部门利益膨胀突出特征包括：部门利益最大化，部门利益法定化，部门利益国家化，部门利益国际化。而部门利益膨胀的原因在于公共权力市场化，利益集团施加影响，以及财政、立法制度不健全。
分析人士指出，官方媒体在中共中央全会期间如此严词批评中央部门还比较罕见，联系到官方媒体近日提出要防范某些利益集团通过与政府官员进行“权钱交易”，形成损害公共利益的“特殊利益集团”，预计中共在六中全会后将采取比较具体的措施，防止政府部门和官员成为“特殊利益集团”的代理人，减少眼下公众对于腐败严重、社会不公、贫富差距过大的严重不满。
新华社不久前发表文章说，在市场经济体制不健全的情况下，中国的金融、电力、交通、电信、能源等垄断行业最容易演变成“特殊利益集团”，因为这些部门长期盘踞公共资源高地并独占利润，把相当一部分应当归社会共享的成果变成部门利益，享受过高的收入和过高的福利。
一些机构挟洋自重
巩固谋取部门利益
江涌的文章指出，长期以来，中国行政的突出特点是：决策与执行不分，机构设置偏多，职权交叉重叠。在具体行政过程中，凡是能巩固、谋取部门利益的，则积极“作为”；凡是与部门利益相抵触、难以谋取部门利益的，则消极“不作为”。
同时，一些中央机构打着“与国际接轨”的旗号，利用增进对外交往、加强对外合作等时机，以“接受国际惯例”、“增强国际竞争力”等为借口，挟洋以自重，巩固、谋取部门利益。
文章指出，众多境外与涉外利益集团，如各国在华商会以及中国外商投资企业协会（商务部下属的行业协会），通过母国政府或政治游说，或收买、利用高干子女、亲属，或聘请一些部门领导与职员做咨询师，或将相关课题并配以丰厚的课题经费，给予各大部委研究机构与学者等途径，对中国相关部门决策与立法施加巨大影响。这是中国大量政经信息外泄、经济高度对外依赖、独立自主的工业体系受损、外企长期保持“超国民待遇”不变以及内外企税率未能统一等一系列重要问题的症结所在。
而众多行业的民营企业家争当人大代表或政协委员，利用人大与政协这两大政治舞台，来谋取利益；或私下聘请相关专家学者担任独立董事，为其摇旗呐喊，或通过行贿等不正当的利益输送直接影响行政决策。自中央推行宏观调控抑制房地产价格过快增长的政策出台后，有的房地产开发商迅即与一些专家学者、房地产研究机构、部分媒体、甚至官员联手，强占行业话语制高点，并形成一个行业性的“话语链”，以对抗宏观调控。